樟科(Lauraceae)厚壳桂族(Cryptocaryeae)包含约12属850种,是典型的热带起源类群。在我国广西壮族自治区,该族中厚壳桂属(Cryptocarya)、琼楠属(Beilschmiedia)及油果樟属(Syndiclis)均有自然分布。其中,厚壳桂属在我国记录近20种,但种间系统发育关系尚不明确。我院宋钰课题组与中国科学院西双版纳热带植物园的研究人员合作,在厚壳桂属系统学研究中取得了新进展。

图1、广东厚壳桂线粒体基因组和叶绿体基因组物理图谱
课题组首先完成了广东厚壳桂(Cryptocarya kwangtungensis)完整的线粒体基因组(mtDNA)和叶绿体基因组(cpDNA)的测序和组装,其长度分别为758,020 bp和157,057 bp (图1)。在线粒体基因组中,共鉴定出1,275个重复序列和234个简单重复序列(SSR)。同时,线粒体与叶绿体基因组之间检测到35个同源DNA片段,提示两者间可能存在频繁的遗传信息交流。基因同线性分析表明,广东厚壳桂与其它木兰类测序物种——包括北美鹅掌楸(Liriodendron tulipifera)、望春玉兰(Magnolia biondii)、莲叶桐(Hernandia nymphaeifolia)及小花檬果樟(Caryodaphnopsis henryi)——之间存在广泛的线粒体基因重排现象,仅发现5个保守基因簇,即sdh4-cox3-atp8、rps12-nad3、 rpl16-rps3、 rpl5-rps14-cob及atp4-nad4L。基于线粒体基因组保守序列(mtDNA)与核糖体顺反子序列(nrDNA)矩阵重建的系统发育树显示,分布于亚洲的21种厚壳桂属林木可聚为三个主要分支:第一支包含厚壳桂、丛花厚壳桂及一种印度尼西亚产厚壳桂;第二支涵盖白背厚壳桂、广东厚壳桂、南烛厚壳桂等9个物种;第三支则由黄果厚壳桂、硬壳桂、钝叶厚壳桂等9个物种组成(图2)。

图2、基于线粒体基因组序列构建厚壳桂属植物的系统发育关系
上述研究成果以" Genomic insights and phylogenetics of the mitochondrial genome of Cryptocarya"为题,发表于国际分子生物学领域期刊《Genomics》。我院硕士应届毕业生黄杰鹏为该论文第一作者,宋钰和谭运洪共同担任通讯作者。本研究得到广西科技基地和人才专项(GuikeAD23026281)及国家自然科学基金(32260060 & 31970223)等的联合资助。